Tomcat_Vasiliy

Но Умибодзу генсеку не подчинено. Тогда кому подчинено - правительству вообще?

Anshin

А насчет правительства да, упоминание комитета намекает.

На вики прочитал, что принадлежат они Морским силам самообороны Японии, JMSDF.

Anshin

Отдел ликвидировали в отместку, но был и официальный повод в виде закона о расформировании подобных групп, плюс легенда о террористах.

Которую точно запустил сам Якусима. Гипотетически он всё-таки мог если не приказы отдавать, то влиять на Умибодзу?
Пошёл пересматривать весь 24-й эпизод и наткнулся на очень важный диалог:
_момент 11:45_
Мотоко: Только что я получила закодированное сообщение от шефа. Скоро здесь будет военный спецназ.
Бато: Закон об ограничении полномочий спецподразделений?
Мотоко: Как только кабинет министров примет решение, всё будет кончено. Всё как обычно - ни ума, ни фантазии.

Motoko: I got an encrypted transmission from the Chief a while ago. A military special forces unit is probably going to try to take this building soon
Batou: So, the Special Forces Restriction Bill passed, huh?
Motoko: By the time a special Cabinet meeting has authorized military action, it's already over. It happens all the time.
То есть, в инглиш версии она не произносит полное название органа, который решил их прикончить. Просто какой-то special Cabinet. Банальное упрощение разговорной речи? Явно, так и есть. Не думаю, что имеет место иная структура кроме Кабинета министров, что подходит под такое словосочетание.

Секретариат Кабинета министров Японии (яп. 内閣官房 Найкаку-камбо) — центральный орган исполнительной власти, во главе с генеральным секретарём Кабинета министров.
Кабинет министров Японии (яп. 内閣 найкаку) — высший исполнительный орган государства

оценивая чисто на слух, Майор произносит просто "найкаку".

_момент 6:43_
Арамаки: Я угробил столько лет на создание отдела, а вы хотите уничтожить его?
Премьер: Я бы сказал, что пришло время использовать эти силы.

• This is the asset that I've spent all this time building up! You're asking me to...
• ... that the time has come to make use of those assets, wouldn't you?

То есть, выдаёт лицензию на убийство спецназовцев в экзоскелетах. Если справитесь, конечно, хе-хе

Аранаки сам себе восстановил отдел, или всё-таки премьер ему помог? Сделка заключалась в том, что его не тронули и отпустили гулять под подписку? Прямого ответа сериал не даёт, только намекает, но слишком уж незаметно. После встречи с премьером они с Тогусой садятся в машину и едут прямо к министру юстиции. Была надежда, что тот даст делу генсека ход сразу?

Смотрю дальше, момент 7:50
Группы 3 и 4 десантируются с воздуха и занимают ангар через вертолётную площадку. В раковине 9 татиком. (in the shell ??) Главная задача - уничтожение.
Группы 5 и 6 - арестовать 7-рых сотрудников отдела и взять под контроль все средства связи. Эти ребята специалисты в информационных войнах - только силовой захват!
Выходит, они не знали, что все татикомы давно "на лечении", не знали, что седьмой Тогуса отсутствует, что Майор спрятала данные в микрочипы в сигаретках и что она может менять тела как перчатки? Хороша разведка. Может, кабмин им просто не сказал что нужно уничтожить папочку Якусимы, а дал приказ более обтекаемо, так что бедные чёрные спецназовцы действительно верили, что сражаются с террористами, планирующими переворот. Только до меня дошло. Командир действительно жалуется на информацию сверху на тринадцатой минуте (заметив, что татиком и правда нет)

и наконец:
_момент 22:00_
Командир в беретке общается с кем-то по рации.
Ком: Что вы имеете ввиду, сэр? Выпускать бойцов в бронекостюмах - безумие. Мы с ними справимся и без спецсредств так.
Голос: Не в наших интересах сейчас действовать в открытую. Здание взято под охрану. / Полиции? Так же в выпуске новостей говорят, что члены отдела сопротивлялись именно полиции.
англ:
- These are not people that we can beat without taking every precaution
т.е. другой мысл:

• Все меры предосторожности нам как раз нужны,
• Нет. Оставляйте тяжёлых киборгов разбомбленный офис сторожить, а сбежавших ищите остальными силами.